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最新冷冻电镜(cryo-EM)图像重构GPU工作站配置推荐2023v1

时间:2021-07-03 00:00:00   来源:UltraLAB图形工作站方案网站   人气:3541 作者:admin

升级和更新日期:2023年02月16日

升级关键点:

(1)硬件配置:GPU采用最新RTX4080/RTX4090,整体性能提升

(2)系统和软件:支持Relion、SCIPION、CRYOSPARC,全部装好,机器到手,开机即用

(3)价格下调

 

(一)GPU计算卡升级换代

【GPU计算卡】已经升级换代,已经从RTX20系列升级到RTX30系列,可供选择的高速GPU卡:RTX3070、RTX3080、RTX3090、RTX A6000,处理性能大幅提升,其算力大致如下:

No

型号

卡数

CUDA核数

FP32    (单位Tflops)

张量计算FP16(单位Tflops)

显存带宽GBs

显存合计GB

1

A6000

8块

86016

320

2496

768

384

2

RTX3090

8块

83968

285

2280

936

192

3

A6000

7块

75264

280

2184

768

336

4

RTX3090

7块

73472

249

1995

936

168

5

A6000

6块

64512

240

1872

768

288

6

RTX3080

8块

69632

238

1904

760

80

7

A5000

8块

65536

222

1728

768

192

8

RTX3090

6块

62976

213

1710

936

144

9

A6000

5块

53760

200

1560

768

240

10

RTX3080

6块

52224

179

1428

760

60

11

RTX3090

5块

52480

178

1425

936

120

12

A5000

6块

49152

166

1302

768

144

13

A6000

4块

43008

160

1248

768

192

14

RTX3080

5块

43520

149

1190

760

50

15

RTX3090

4块

41984

142

1140

936

96

16

RTX3080Ti

4块

69632

136

1064

912

48

17

RTX3070

7块

41216

142

1141

448

56

18

A5000

5块

40960

139

1085

768

120

19

RTX3070

6块

35328

122

978

448

48

20

RTX3080

4块

34816

119

952

760

40

21

A5000

4块

32768

111

868

768

96

22

RTX3090

3块

41984

107

855

936

72

23

RTX3080Ti

3块

34816

102

798

912

36

24

RTX3070

5块

29440

102

815

448

40

25

RTX3080

3块

34816

89

714

760

40

26

A5000

3块

24576

83

651

768

72

27

RTX3070

4块

23552

81

652

448

32

28

A6000

2块

21504

80

624

768

96

29

RTX3090

2块

20992

71

570

936

48

30

RTX3080Ti

2块

20480

68

532

912

24

31

RTX3070

3块

23552

61

489

448

24

32

RTX3080

2块

17408

60

476

760

20

33

A5000

2块

16384

55

432

768

48

34

RTX3070

2块

11776

41

326

448

16

35

A6000

1块

10752

40

312

768

48

36

RTX3090

1块

10496

36

285

936

24

37

RTX3080Ti

1块

10240

34

266

912

12

38

RTX3080

1块

8704

30

238

760

10

39

A5000

1块

8192

28

217

768

24

40

RTX3070

1块

5888

20

163

448

8

 

另外,与以前的版本相比,【RELION 3.1】中的新功能允许更快、更自动化和更高分辨率的冷冻电镜结构测定。

RTX3090处理能力的测试截图:

relion310-rtx3090-benchmark.png

相关测试证明 RTX3090比上一代RTX2080ti,3D分类 加速40%,二维分类加速70%

数据来源:https://www.linuxvixion.com/blog/relion-fastest-ever-benchmark/



(二)UltraLAB冷冻电镜计算设备机型介绍

西安坤隆计算机科技有限公司自2019年推出基于冷冻电镜图像重构工作站配置方案,至今已二年多,UltraLAB工作站将升级换代,推出新机型配置方案,其特点具有架构更新、计算速度更快、存储容量更大。

第1类  UltraLAB GA300/GT420(服务器级)产品特点

CA300-Relion.jpg
技术规格

NO

机型

GA300

GT420

1

CPU

Intel 11代高频处理器

6核@4.8GHz

8核@4.8GHz

 

Intel 3代Xeon处理器

2

芯片组

Z590+PCH

C621A+PCH

3

内存

DDR4 3200

最大128GB

DDR4 2933

最大1TB

4

GPU

最大2块(双/三槽卡)

双PCIe 4.0 x8

最大2块(三槽卡)

最大4块(双槽卡)

5

硬盘位

8个3.5寸

最大144TB

8个3.5寸

最大144TB

6

电源

2000W

2000W

特点:
【GA300机型】支持PCIe 4.0 x16,如果是双卡,每个卡的接口PCIe 4.0 x8,相当于PCIe 3.0 x16
【GT410机型】最大特点是内存比GA300能提供更大容量内存



第2类 GT420M/GX650M(工作站级)产品特点
GX650M-A4.jpg

技术规格

NO

机型

GT420M

GX650M

1

CPU

1颗Xeon三代可扩展处理器

43xx/53xx/6300x/8300x系列(最大40核)

2颗Xeon 三代可扩展处理器

43xx/53xx/63xx/83xx系列(最大80核)

2

芯片组

C621A+PCH

C621A+PCH

3

内存

DDR4 3200/2933/2666

最大1TB

DDR4 3200/2933/2666

最大2TB

4

GPU

最大4块(双/三槽卡)

四个PCIe 4.0 x8

最大6块(三槽卡)

最大7块(双槽卡)

6个PCIe 4.0 x16(全速)

5

硬盘位

16个3.5寸

最大270TB

16个3.5寸

最大270TB

6

电源

双2000W

双2000W

7

噪音等级

静音级

静音级

特点:
GT420M机型 与其他品牌机器相比,这是市场上唯一可以支持4块三槽GPU卡、最大270TB,同时静音的工作站。
GX650M机型最大特点是目前市场上唯一支持6块三槽GPU卡,全部PCIe x16,最大270TB存储,还能整机保证静音级。

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(三)冷冻电镜GPU工作站硬件配置推荐2023v1

NO

品牌与型号

配置规格

算力

FP32

Tflops

价格

求解能力

图片分辨率参考

1

GA320P 15164-36T2X

intel 13代高频处理器(14核,其中6核@5.1GHz,8核3.9GHz )/ 64GB DDR5 /2*RTX4080 16GB/1TB M2.SSD系统盘 /2*18TB SATA企业级/双式(2000w)/27寸-4K显示器

80T

71000

200x200

2

GA300 149128-48T2T

intel 13代高频处理器(16核,其中8核@5.3GHz,8核4.0GHz )/ 128GB DDR5 /2*RTX4090 24GB /2TB M2.SSD系统盘 / 3*18TB SATA企业级/双塔式(2000w)/ 27寸-2K显示器

164T

92900

360x360

3

GT420M 128128-64T2T

Xeon 银4314(16核@2.8GHz )/ 128GB DDR4 /2*RTX4090 24GB/2TB M2.SSD系统盘 /5*18TB SATA企业级/塔式(2000w)/ 27寸-4K显示器

164T

99990

360x360

4

GT650M 228192-72T2T

2*Xeon 银4314(32核@2.8GHz )/192GB DDR4 /2*RTX4090 24GB/3.84TB PCIeSSD系统盘/4*18TB SATA企业级/双塔(2000w)/ 27寸-4K显示器

164T

112000

360x360

5

GA320P 157128-54T3T

intel 13代高频处理器(24核,其中8核@5.7GHz,16核4.0GHz )/ 128GB DDR5 /3*RTX4090 24GB /2TB M2.SSD系统盘 / 3*18TB SATA企业级/双塔式(2000w)/ 27寸-2K显示器

 

240T

119900

400x400

6

GX650M 228256-126T4T

2颗Xeon 银4316(40核@2.8GHz )/ 256GB DDR4 /4*RTX4090  24GB/3.84TB PCIeSSD/126TB并行存储/双塔(2*2000w)/ 27寸-4K显示器

320T

186000

500x500

7

GX650M 233384-240T6E

2颗Xeon 金6326(32核@3.3GHz )/ 384GB DDR4 /6*A6000 48GB /960GB SSD/7.68TB PCIeSSD系统盘 /240TB并行存储/双塔(2*2000w)/ 27寸-4K显示器

240T

379000

600x600

 
关于RELION基准测试和计算机硬件资料  
https://www3.mrc-lmb.cam.ac.uk/relion/index.php/Benchmarks_%26_computer_hardware#Accelerated_RELION.2C_using_GPUs_or_CPU-vectorization

 

上述所有配置,代表最新硬件架构,同时保证是最完美,最快,如有不符,可直接退货

欲咨询机器处理速度如何、技术咨询、索取详细技术方案,提供远程测试,请联系


UltraLAB图形工作站供货商:
西安坤隆计算机科技有限公司
国内知名高端定制图形工作站厂家
业务电话:
400-705-6800

咨询微信号:

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