最新冷冻电镜(cryo-EM)图像重构GPU工作站配置推荐2023v1

时间:2021-07-03   来源:   网友评论:0   人气: 470 作者:

升级和更新日期:2023年02月16日

升级关键点:

(1)硬件配置:GPU采用最新RTX4080/RTX4090,整体性能提升

(2)系统和软件:支持Relion、SCIPION、CRYOSPARC,全部装好,机器到手,开机即用

(3)价格下调

 

(一)GPU计算卡升级换代

【GPU计算卡】已经升级换代,已经从RTX20系列升级到RTX30系列,可供选择的高速GPU卡:RTX3070、RTX3080、RTX3090、RTX A6000,处理性能大幅提升,其算力大致如下:

No

型号

卡数

CUDA核数

FP32    (单位Tflops

张量计算FP16(单位Tflops)

显存带宽GBs

显存合计GB

1

A6000

8

86016

320

2496

768

384

2

RTX3090

8

83968

285

2280

936

192

3

A6000

7

75264

280

2184

768

336

4

RTX3090

7

73472

249

1995

936

168

5

A6000

6

64512

240

1872

768

288

6

RTX3080

8

69632

238

1904

760

80

7

A5000

8

65536

222

1728

768

192

8

RTX3090

6

62976

213

1710

936

144

9

A6000

5

53760

200

1560

768

240

10

RTX3080

6

52224

179

1428

760

60

11

RTX3090

5

52480

178

1425

936

120

12

A5000

6

49152

166

1302

768

144

13

A6000

4

43008

160

1248

768

192

14

RTX3080

5

43520

149

1190

760

50

15

RTX3090

4

41984

142

1140

936

96

16

RTX3080Ti

4

69632

136

1064

912

48

17

RTX3070

7

41216

142

1141

448

56

18

A5000

5

40960

139

1085

768

120

19

RTX3070

6

35328

122

978

448

48

20

RTX3080

4

34816

119

952

760

40

21

A5000

4

32768

111

868

768

96

22

RTX3090

3

41984

107

855

936

72

23

RTX3080Ti

3

34816

102

798

912

36

24

RTX3070

5

29440

102

815

448

40

25

RTX3080

3

34816

89

714

760

40

26

A5000

3

24576

83

651

768

72

27

RTX3070

4

23552

81

652

448

32

28

A6000

2

21504

80

624

768

96

29

RTX3090

2

20992

71

570

936

48

30

RTX3080Ti

2

20480

68

532

912

24

31

RTX3070

3

23552

61

489

448

24

32

RTX3080

2

17408

60

476

760

20

33

A5000

2

16384

55

432

768

48

34

RTX3070

2

11776

41

326

448

16

35

A6000

1

10752

40

312

768

48

36

RTX3090

1

10496

36

285

936

24

37

RTX3080Ti

1

10240

34

266

912

12

38

RTX3080

1

8704

30

238

760

10

39

A5000

1

8192

28

217

768

24

40

RTX3070

1

5888

20

163

448

8

 

另外,与以前的版本相比,【RELION 3.1】中的新功能允许更快、更自动化和更高分辨率的冷冻电镜结构测定。

RTX3090处理能力的测试截图:

relion310-rtx3090-benchmark.png

相关测试证明 RTX3090比上一代RTX2080ti,3D分类 加速40%,二维分类加速70%

数据来源:https://www.linuxvixion.com/blog/relion-fastest-ever-benchmark/



(二)UltraLAB冷冻电镜计算设备机型介绍

西安坤隆计算机科技有限公司自2019年推出基于冷冻电镜图像重构工作站配置方案,至今已二年多,UltraLAB工作站将升级换代,推出新机型配置方案,其特点具有架构更新、计算速度更快、存储容量更大。

第1类  UltraLAB GA300/GT420(服务器级)产品特点

CA300-Relion.jpg
技术规格

NO

机型

GA300

GT420

1

CPU

Intel 11代高频处理器

6@4.8GHz

8@4.8GHz

 

Intel 3代Xeon处理器

2

芯片组

Z590+PCH

C621A+PCH

3

内存

DDR4 3200

最大128GB

DDR4 2933

最大1TB

4

GPU

最大2块(双/三槽卡)

PCIe 4.0 x8

最大2块(三槽卡)

最大4(双槽卡)

5

硬盘位

83.5

最大144TB

83.5

最大144TB

6

电源

2000W

2000W

特点:
【GA300机型】支持PCIe 4.0 x16,如果是双卡,每个卡的接口PCIe 4.0 x8,相当于PCIe 3.0 x16
【GT410机型】最大特点是内存比GA300能提供更大容量内存



第2类 GT420M/GX650M(工作站级)产品特点
GX650M-A4.jpg

技术规格

NO

机型

GT420M

GX650M

1

CPU

1颗Xeon三代可扩展处理器

43xx/53xx/6300x/8300x系列(最大40核)

2Xeon 三代可扩展处理器

43xx/53xx/63xx/83xx系列(最大80核)

2

芯片组

C621A+PCH

C621A+PCH

3

内存

DDR4 3200/2933/2666

最大1TB

DDR4 3200/2933/2666

最大2TB

4

GPU

最大4块(双/三槽卡)

四个PCIe 4.0 x8

最大6块(三槽卡)

最大7(双槽卡)

6PCIe 4.0 x16(全速)

5

硬盘位

163.5

最大270TB

163.5

最大270TB

6

电源

2000W

2000W

7

噪音等级

静音级

静音级

特点:
GT420M机型 与其他品牌机器相比,这是市场上唯一可以支持4块三槽GPU卡、最大270TB,同时静音的工作站。
GX650M机型最大特点是目前市场上唯一支持6块三槽GPU卡,全部PCIe x16,最大270TB存储,还能整机保证静音级。


 

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